Foods

AS Berlomba untuk Mengejar dalam Upaya Mendeteksi Virus Mutan

Big News Network


NEW YORK – Terlepas dari sistem medis kelas dunia dan Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit yang dibanggakan, AS tertinggal dalam perlombaan untuk mendeteksi mutasi virus corona yang berbahaya. Dan itu baru sekarang mulai menyusul.

Masalahnya bukanlah kekurangan teknologi atau keahlian. Sebaliknya, para ilmuwan mengatakan, ini adalah ketiadaan kepemimpinan dan koordinasi nasional, ditambah kurangnya dana dan persediaan untuk laboratorium yang terlalu terbebani yang mencoba menyulap pengujian diagnostik dengan perburuan perubahan genetik.

“Kami memiliki otak. Kami memiliki alat. Kami memiliki instrumen,” kata Ilhem Messaoudi, direktur pusat penelitian virus di University of California, Irvine. “Ini hanya masalah mendukung upaya itu.”

Virus bermutasi secara konstan. Untuk tetap berada di depan ancaman, para ilmuwan menganalisis sampel, mengamati dengan cermat mutasi yang mungkin membuat virus corona lebih menular atau lebih mematikan.

Tetapi pengujian semacam itu telah tersebar luas.

Kurang dari 1% spesimen positif di AS sedang diurutkan untuk menentukan apakah mereka memiliki mutasi yang mengkhawatirkan. Negara-negara lain lebih baik – Inggris mengurutkan sekitar 10% – yang berarti mereka dapat lebih cepat melihat ancaman datang pada mereka. Itu memberi mereka kesempatan lebih besar untuk memperlambat atau menghentikan masalah, baik melalui pelacakan kontak yang lebih bertarget, kemungkinan penyesuaian vaksin, atau peringatan publik.

Pejabat CDC mengatakan varian tidak mendorong lonjakan baru-baru ini dalam kasus AS secara keseluruhan. Tetapi para ahli khawatir bahwa apa yang terjadi dengan varian tidak jelas dan mengatakan bahwa negara seharusnya lebih agresif dalam mengurutkan lebih awal epidemi yang sekarang telah menewaskan lebih dari 450.000 orang Amerika.

“Jika kita punya bukti bahwa itu berubah,” kata ahli biologi molekuler Ohio State Dan Jones, “mungkin orang akan bertindak berbeda.”

Ilmuwan AS telah mendeteksi lebih dari 500 kasus varian yang pertama kali diidentifikasi di Inggris dan berharap itu menjadi penyebab sebagian besar infeksi baru negara ini dalam hitungan minggu. Varian lain yang mengganggu terkait dengan Brasil dan yang ketiga ditemukan di Afrika Selatan terdeteksi minggu lalu di AS dan juga diperkirakan akan menyebar.

Varian Inggris lebih menular dan diyakini lebih mematikan daripada yang asli, sedangkan Afrika Selatan mungkin membuat vaksin agak kurang efektif. Ketakutan utama adalah bahwa varian yang kebal terhadap vaksin dan perawatan yang ada pada akhirnya dapat muncul.

Versi yang berpotensi mengkhawatirkan juga dapat terbentuk di AS. “Virus ini bermutasi, dan tidak peduli di Idaho atau Afrika Selatan,” kata Messaoudi.

Tetapi dimensi sebenarnya dari masalah di AS tidak jelas karena tingkat pengurutan yang relatif rendah.

“Anda hanya melihat apa yang ada di bawah tiang lampu,” kata Kenny Beckman, direktur University of Minnesota Genomics Center, yang mulai menganalisis genetika virus musim semi lalu.

Petugas medis membawa pasien keluar dari ambulans di luar Rumah Sakit Royal London di London timur, 4 Februari 2021.

Setelah awal yang lambat, laboratorium kesehatan masyarakat di setidaknya 33 negara bagian sekarang melakukan analisis genetik untuk mengidentifikasi varian virus corona yang muncul. Negara bagian lain telah membentuk kemitraan dengan universitas atau laboratorium swasta untuk melakukan pekerjaan tersebut. North Dakota, yang mulai mengurutkan minggu lalu, adalah yang paling baru memulai pekerjaan itu, menurut Asosiasi Laboratorium Kesehatan Masyarakat.

CDC percaya minimal 5.000 hingga 10.000 sampel harus dianalisis setiap minggu di AS untuk memantau varian secara memadai, kata Gregory Armstrong, yang mengawasi pekerjaan deteksi molekuler lanjutan dari badan tersebut. Dan baru sekarang negara mencapai level itu, akunya.

Namun, ini adalah pendekatan yang campur aduk: Beberapa laboratorium kesehatan masyarakat mengurutkan setiap spesimen virus positif. Beberapa fokus pada sampel dari wabah tertentu atau pasien tertentu. Yang lain secara acak memilih sampel untuk dianalisis.

Selain itu, laboratorium terus mengalami kesulitan mendapatkan persediaan yang dibutuhkan – seperti ujung pipet dan bahan kimia – yang digunakan dalam pengurutan gen dan pengujian diagnostik.

Presiden Joe Biden, yang mewarisi pengaturan dari pemerintahan Trump, mengusulkan paket bantuan COVID-19 senilai $ 1,9 triliun yang menyerukan untuk meningkatkan pengeluaran federal untuk pengurutan virus, meskipun jumlahnya belum dirinci dan hal spesifik lainnya belum dikerjakan. di luar.

“Kami berada di urutan ke-43 di dunia dalam pengurutan genom. Sama sekali tidak dapat diterima,” kata koordinator tanggapan virus korona Gedung Putih Jeff Zients.

Selama lebih dari lima tahun, laboratorium kesehatan masyarakat AS telah membangun kemampuan mereka untuk melakukan pengurutan genom, sebagian besar berkat dorongan federal untuk membidik sumber wabah keracunan makanan.

Pada awal pandemi, beberapa laboratorium segera mulai mengurutkan virus corona. Departemen Kesehatan Minnesota, misalnya, mulai melakukannya dalam beberapa minggu setelah kasus COVID-19 pertama pada Maret, kata Sara Vetter, asisten direktur lab. “Itu membuat kami selangkah lebih maju,” katanya.

CDC juga bekerja dengan negara bagian tertentu untuk mengurutkan hampir 500 sampel pada bulan April, dan lebih dari seribu sampel pada bulan Mei dan Juni.

Tetapi banyak laboratorium tidak melakukan hal yang sama – terutama yang terbebani dengan pengujian diagnostik virus korona. Armstrong dari CDC mengatakan bahwa pada saat itu, dia tidak dapat membenarkan memberi tahu lab untuk melakukan lebih banyak pengurutan ketika mereka sudah penuh dan tidak ada bukti bahwa analisis semacam itu diperlukan.

“Sampai sebulan yang lalu, itu tidak ada dalam daftar hal-hal yang sangat diperlukan. Senang rasanya memilikinya,” kata Trevor Bedford, seorang ilmuwan di Fred Hutchinson Cancer Research Center di Seattle. “Jelas ada kekurangan sumber daya federal yang ditugaskan untuk melakukan hal ini.”

Pada saat yang sama, karena perintah tinggal di rumah diberlakukan selama wabah, para peneliti di beberapa laboratorium diberitahu untuk tidak bekerja, kata Messaoudi.

“Alih-alih meminta bantuan,” katanya, “mereka mengirim semua orang pulang.”

Namun, selama musim panas, sekelompok ilmuwan membunyikan alarm tentang status pengawasan genom di AS dan mulai mendorong sesuatu yang lebih sistematis.

Pada bulan November, CDC mulai meluncurkan program nasional untuk menarik dan memeriksa spesimen secara lebih metodis untuk lebih menentukan strain apa yang beredar. Kemudian pada bulan Desember, AS mendapat peringatan ketika peneliti Inggris mengumumkan bahwa mereka telah mengidentifikasi varian yang tampaknya menyebar lebih mudah.

CDC bereaksi dengan mengumumkan program pengawasannya akan meningkatkan untuk memproses 750 sampel secara nasional per minggu. Agensi tersebut juga mengontrak tiga perusahaan – LabCorp, Quest Diagnostics dan Illumina – untuk mengurutkan ribuan lagi setiap minggu. Lab negara bagian melakukan ribuan tugasnya sendiri.

Sementara itu, wabah tersebut hampir pasti menumbuhkan lebih banyak mutasi COVID-19.

“Di mana ia memiliki kendali bebas pada tempatnya, akan ada varian signifikan yang berkembang,” kata ilmuwan Scripps Research Institute Dr. Eric Topol. “Semakin banyak pengurutan genom, semakin kita bisa berada di depan virus.”

Author : Togel SDY